CI-NBE计算任务无法运行的问题咨询

HanC

sob老师，各位老师好！学生遇到了在租的服务器上无法进行CI-NBE计算的问题：
  在完成了起始结构和产物结构后，今天首次尝试了CI-NBE的计算以搜索过渡态并获得其能量。但是出现了无法在服务器上运行的情况，并对可能存在的问题进行了排除。
  1.最可能存在的爆内存的问题，在输出结果中也给予了相关提示：
            BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
            RANK 0 PID 18507 RUNNING AT node14
            KILLED BY SIGNAL:9 (Killed)

      为保证不出现爆内存的情况，特把NPROC_REP调大，但出现了  “并未出现报错，但无法进行计算”的问题。非常疑惑，特向各位老师请教可能出现的问题，为什么无法进行计算。
  2.排除租的服务器的问题： ① 进行了其他任务的计算（如：几何优化任务），其计算可以正常进行，并未出现无法计算的情况
                                         ② 利用sob老师在CP2K培训班中所讲的算例， "质子穿过石墨烯"进行计算，调大NPROC_REP后，在服务器上可以正常计算，不会出现无法进行的情况。
  在咨询服务器客服无果、调整模型、调大NPROC_REP和排除服务器问题后，向各位老师请教，是否遇到过相同问题，对解决该问题应该如何着手进行？
  感谢各位老师，期待各位老师的回复。

Dempey

查看你的压缩包中NEB-BAND01.out，这个文件最后有报错：

1. *******************************************************************************
   
2. *   ___                                                                       *
   
3. *  /   \                                                                      *
   
4. * [ABORT]                                                                     *
   
5. *  \___/    Illegal combination of periodicity and Poisson solver periodic3d  *
   
6. *    |                                                                        *
   
7. *  O/|                                                                        *
   
8. * /| |                                                                        *
   
9. * / \                                               pw/pw_poisson_types.F:208 *
   
10. *******************************************************************************

复制代码

这是因为你的&FORCE_EVAL/&DFT/&POISSON中PERIODIC、PSOLVER设置不匹配，你可以完全使用Multiwfn生成输入文件。你可以使用MT的PSOLVER，但是需要足够的真空层，或者把&FORCE_EVAL/$SUBSYS/&CELL中的PERIODIC设置为XYZ，&FORCE_EVAL/&DFT/&POISSON中PERIODIC、PSOLVER设置为XYZ和PERIODIC。

HanC

Dempey 发表于 2024-9-10 14:43
查看你的压缩包中NEB-BAND01.out，这个文件最后有报错：

这是因为你的&FORCE_EVAL/&DFT/&POISSON中PERIO ...

  非常感谢老师您的回复，受益匪浅！
  经验缺乏，我只检查了最后的结果文件，不清楚检查前面的out文件可以查到报错的可能，非常感谢！
  按照老师的您所说的，已经可以运行了，非常感谢。