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[新手求助] 求助在生物体内发生的二萜合成反应能垒有60kcal/mol是否合理

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本帖最后由 起个名字特难丶 于 2024-4-18 10:03 编辑

二萜的5555环转变为5654环,能垒有60kcal/mol,过渡态唯一虚频为-1277.75
IRC结果如下:








这是其他文献里对二萜合成的计算,能垒一般不超过15kcal/mol
DFT Study on the Biosynthesis of Verrucosane Diterpenoids and Mangicol Sesterterpenoids: Involvement of Secondary-Carbocation-Free Reaction Cascades | JACS Au

求助各位老师有没有寻找环转变的经验和方法,谢谢各位老师!


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2#
发表于 Post on 2024-4-18 10:20:39 | 只看该作者 Only view this author
完全不合理,60 kcal/mol的能垒在100摄氏度至少需要几千万年才能看到反应。

这种生物反应很可能是酸碱催化的,文献模拟的也是碳正离子的反应。你模拟的好像是中性氢原子在单键上的1,2转移,这个能垒当然极高。

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3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-18 16:51:19 | 只看该作者 Only view this author
dnlx 发表于 2024-4-18 10:20
完全不合理,60 kcal/mol的能垒在100摄氏度至少需要几千万年才能看到反应。

这种生物反应很可能是酸碱催 ...

明白了,谢谢老师,我的电荷和自选多重度为1 1,但是能垒确实很高,我再去寻找其他可能的路径。

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