cp2k metadynamics中运用质心距离作为CV应怎样设置

coookies · 发表于 Post on 2023-3-9 15:28:01

在指定CV时，想用质心距离来运算，但是没有看到类似的例子，就自己尝试写了。
报错显示valuerequested, but no value set getting value from keyword ATOMS of section DISTANCE。
相关码如下，请教大家~
&COLVAR
   &DISTANCE
      &POINT
      TYPE GEO_CENTER
      ATOMS 241..259
      &END
      &POINT
      TYPE GEO_CENTER
      ATOMS 260..278
      &END
      AXIS XYZ
   &END DISTANCE
&END COLVAR

captain · 发表于 Post on 2024-1-30 16:05:39

本帖最后由 captain 于 2024-1-30 16:07 编辑

是不是应该这样设置？
&COLVAR
   &DISTANCE
      &POINT
      TYPE GEO_CENTER
      ATOMS 241..259
      &END
      &POINT
      TYPE GEO_CENTER
      ATOMS 260..278
      &END
   AXIS XYZ
   POINTS 1 2
   &END DISTANCE
&END COLVAR

一昔a · 发表于 Post on 2024-5-15 18:16:09

captain 发表于 2024-1-30 16:05
是不是应该这样设置？
&COLVAR
&DISTANCE

对的，我按照您写的这样尝试了，完全跑的通。

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[CP2K] cp2k metadynamics中运用质心距离作为CV应怎样设置