ClO·自由基抽氢过程优化不出过渡态

littleear · 发表于 Post on 2024-5-2 21:27:28

各位老师同学们好，我想优化ClO·自由基抽2,4-D分子上酚羟基的H的过渡态，O-H-O摆放在了一条直线上，并设置Cl-O-H的键角为107°，但是一直优化不出来。我不断调整H和两个O之间的距离，优化的结果要么是H接在了酚羟基的O原子上，要么接在了ClO·自由基上，或者干脆报convergence failure。我尝试过对ClO·和H之间键长做柔性扫描，但是优化过程中ClO·会到处乱跑，并不会保持O-H-O键大致处于同一直线上。想请教一下各位解决方案，非常感谢

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-2 23:19:44

柔性扫描时对O-H-O键角进行冻结再试
另外，抽氢问题的几何优化必须给转移的那个H带极化函数
此外，当前体系不大，不如用calcall，能增加成功找到过渡态的几率

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-5-3 00:19:45

确定这个反应不是无垒反应吗？

littleear · 发表于 Post on 2024-5-3 09:22:13

sobereva 发表于 2024-5-2 23:19
柔性扫描时对O-H-O键角进行冻结再试
另外，抽氢问题的几何优化必须给转移的那个H带极化函数
此外，当前体 ...

谢谢sob老师，我去试试看看

littleear · 发表于 Post on 2024-5-3 09:23:32

wzkchem5 发表于 2024-5-3 00:19
确定这个反应不是无垒反应吗？

老师好，我之前用·OH和Cl·两个自由基都优化出了这个抽氢过程的过渡态，所以我认为对于ClO·自由基应该也是存在这个过渡态的，不过我再去确认一下，谢谢

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-5-3 15:29:35

littleear 发表于 2024-5-3 02:23
老师好，我之前用·OH和Cl·两个自由基都优化出了这个抽氢过程的过渡态，所以我认为对于ClO·自由基应该 ...

ClO·的氧化性有可能比·OH和Cl·都强，可能导致底物先向ClO·发生无垒的电子转移，得到底物阳离子自由基和ClO-，然后再发生无垒的质子转移

littleear · 发表于 Post on 2024-5-3 22:28:27

wzkchem5 发表于 2024-5-3 15:29
ClO·的氧化性有可能比·OH和Cl·都强，可能导致底物先向ClO·发生无垒的电子转移，得到底物阳离子自由基 ...

好的，谢谢老师

littleear · 发表于 Post on 2024-5-4 11:52:16

wzkchem5 发表于 2024-5-3 15:29
ClO·的氧化性有可能比·OH和Cl·都强，可能导致底物先向ClO·发生无垒的电子转移，得到底物阳离子自由基 ...

老师好，我这两天又尝试了很多方法搜索ClO·自由基的这个抽氢反应过渡态，但是无论如何也找不到，我想请问一下，在这种情况下，我可以直接说这个反应是无垒的吗？或者说还需要经过什么样的计算，才能说这个反应是无垒的呢？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-5-4 15:17:08

littleear 发表于 2024-5-4 04:52
老师好，我这两天又尝试了很多方法搜索ClO·自由基的这个抽氢反应过渡态，但是无论如何也找不到，我想请 ...

按https://bdf-manual.readthedocs.i ... r%20Guide.html#id73的方法判断

littleear · 发表于 Post on 2024-5-4 20:25:49

wzkchem5 发表于 2024-5-4 15:17
按https://bdf-manual.readthedocs.io/zh-cn/latest/User%20Guide.html#id73的方法判断

收到，感谢

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