计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 964|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 如何理解盆分析的结果

[复制链接 Copy URL]

23

帖子

0

威望

191

eV
积分
214

Level 3 能力者

本帖最后由 Yuuya 于 2024-5-16 17:49 编辑

multiwfn
主功能17 Basin analysis
-> 1 Generate basins and locate attractors
-> 1: Generate the basins by selecting a real space function

-> 1 Electron density
-> 4 Lunatic quality grid

最终结果见附件。

我有几个问题:

为什么attractor的坐标与wfn文件内原子坐标不一致?如果我想一一对应到每个原子,有什么办法吗?

最终结果的value的单位和具体意义是什么?


这种量化分析电子密度的方法,和主功能7 population analysis的11号方法ADCH相比,哪一种准度更高?

202405161737541327..png (239.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

盆分析结果

盆分析结果

202405161737225925..png (222.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)

wfn原子坐标

wfn原子坐标

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120109

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-5-16 20:07:17 | 只看该作者 Only view this author
.wfn文件里坐标单位是Bohr,下文说了
利用wfn文件计算电子密度的代码的编写方法
http://sobereva.com/182

而且盆分析基于均匀格点进行分析,吸引子也是落在特定的格点上,通常不可能恰好有一个格点正好和原子核重合

除了极特殊情况外,Multiwfn里没给单位的地方一律是原子单位,手册2.6节一开始就说了。
意义显然就是相应位置的函数的值

跟ADCH原子电荷毫无可比性。先搞清楚盆分析的原理和实际意义再用,看Multiwfn超详细的手册(4.17节有大量例子、3.20节有原理介绍)和相关博文。要用一个功能必须先搞懂它的原理和意义,要么就别用。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-14 04:06 , Processed in 0.165697 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list