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[新手求助] 关于电化学体系下优化有机分子结构和计算能量的问题

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各位老师好,我想计算某个有机分子,如苯酚,在电化学体系下的最优构型和单点能。那么有必要在Gaussian中写入电场吗?如果实际电化学体系的电场能量是9V,在Gaussian中该输入多大能量的电场?电场方向该如何确定呢?

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发表于 Post on 2024-5-13 19:28:26 | 只看该作者 Only view this author
电场的单位是V/m,不是V。9V是电压而非电场。
一般电化学体系里的电场远不足以让分子结构有明显变化(起码当分子比较小时如此)。至于什么情况下电场可以强到让分子结构有明显变化,可以看Chem. Soc. Rev., 2018, 47, 5125--5145

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johngu111 + 5 谢谢

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-13 20:53:18 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-5-13 19:28
电场的单位是V/m,不是V。9V是电压而非电场。
一般电化学体系里的电场远不足以让分子结构有明显变化(起码 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2024-5-14 07:34:13 | 只看该作者 Only view this author
常见实验强度的电场容易影响极性分子的整体朝向,或者影响某些容易旋转的极性基团的朝向而令构象变化,而要影响骨架结构是做不到的。参考下文不同大小电场对结构的影响
一篇文章深入揭示外电场对18碳环的超强调控作用
http://sobereva.com/570http://bbs.keinsci.com/thread-19364-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-14 09:27:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-14 07:34
常见实验强度的电场容易影响极性分子的整体朝向,或者影响某些容易旋转的极性基团的朝向而令构象变化,而要 ...

谢谢老师,看了您的博文,实验电场可能对分子的电子分布造成影响,如果我想用静电势和ALIE分析分子在这个体系中的活性位点,那是不是必须加上电场?如何设定电场的方向比较合理呢?

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发表于 Post on 2024-5-14 14:37:15 | 只看该作者 Only view this author
johngu111 发表于 2024-5-14 02:27
谢谢老师,看了您的博文,实验电场可能对分子的电子分布造成影响,如果我想用静电势和ALIE分析分子在这个 ...

静电势、ALIE只是近似的判据,首先应当判断实验所用电场对电子分布的影响是否大于静电势、ALIE判断活性位点的误差,如果远小于的话,那么加不加电场都无所谓
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-14 18:00:38 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-5-14 14:37
静电势、ALIE只是近似的判据,首先应当判断实验所用电场对电子分布的影响是否大于静电势、ALIE判断活性位 ...

这个能用什么办法判断呢?是加电场和不加电场都算一下再比较吗?

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发表于 Post on 2024-5-14 18:57:33 | 只看该作者 Only view this author
johngu111 发表于 2024-5-14 11:00
这个能用什么办法判断呢?是加电场和不加电场都算一下再比较吗?

这样可以,但往往不需要计算,从电场的量级结合经验或者文献就能判断
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-15 12:17:11 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-5-14 18:57
这样可以,但往往不需要计算,从电场的量级结合经验或者文献就能判断

那请问老师如果加电场的话如何设置电场方向比较合理呢?有没有什么特定的规则或者依据呢?

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发表于 Post on 2024-5-15 15:30:50 | 只看该作者 Only view this author
johngu111 发表于 2024-5-15 05:17
那请问老师如果加电场的话如何设置电场方向比较合理呢?有没有什么特定的规则或者依据呢?

你必然知道这个加电场的实验是怎么做的,由实验的设计来确定分子和电场的相对取向
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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