CP2K计算报错---CPASSERT failed

nianbin · 发表于 Post on 2021-12-8 09:44:55

各位老师好，我使用gmx insert-molcules 构建了初始pdb结构，然后使用卢老师的Multiwfn建立了CP2K的初始输入文件。
但是提交到服务器上之后出现如下报错

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* ___                                                                      *
*  / \                                                                   *
* [ABORT]                                                                   *
*  \___/                            CPASSERT failed                         *
* |                                                                      *
*  O/|                                                                      *
* /| |                                                                      *
* / \                                                 fm/cp_fm_struct.F:300 *
*******************************************************************************

===== Routine Calling Stack =====

         4 mpools_rebuild_fm_pools
         3 qs_env_setup
         2 qs_init_subsys
         1 CP2K
Abort(1) on node 0 (rank 0 in comm 0): application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0

我Google了一下，说是未知错误导致的，想让大家帮我看看哪里出了问题，谢谢

函数与激情 · 发表于 Post on 2021-12-8 09:55:36

CELL部分的BOX给的太小了吧才给了几angstrom，你的分子看起来有几十angstrom长度

sobereva · 发表于 Post on 2021-12-8 10:03:36

说清楚上传的每个文件都是什么
000.inp 计算并没问题

nianbin · 发表于 Post on 2021-12-8 10:06:09

函数与激情发表于 2021-12-8 09:55
CELL部分的BOX给的太小了吧才给了几angstrom，你的分子看起来有几十angstrom长度

应该不是这个问题，我增大了box还是不行

nianbin · 发表于 Post on 2021-12-8 10:09:37

sobereva 发表于 2021-12-8 10:03
说清楚上传的每个文件都是什么
000.inp 计算并没问题

卢老师，难道是我cp2k版本有问题么？我这边计算000.inp就出现上面报错了

nianbin · 发表于 Post on 2021-12-8 10:25:37

sobereva 发表于 2021-12-8 10:03
说清楚上传的每个文件都是什么
000.inp 计算并没问题

卢老师，是不是Multiwfn给的电荷有问题，我把电荷设置为0之后就可以正常计算了

sobereva · 发表于 Post on 2021-12-8 11:36:10

nianbin 发表于 2021-12-8 10:09
卢老师，难道是我cp2k版本有问题么？我这边计算000.inp就出现上面报错了

000.inp都计算不成功说明你的CP2K有问题，明明这个文件里的电荷就是0

用pdb作为输入文件产生CP2K输入文件必须用Multiwfn最新版本

wzdns · 发表于 Post on 2024-5-14 11:48:53

sobereva 发表于 2021-12-8 10:03
说清楚上传的每个文件都是什么
000.inp 计算并没问题

MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD
with errorcode 1.

NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
You may or may not see output from other processes, depending on
exactly when Open MPI kills them.
--------------------------------------------------------------------------

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*  / \                                                                   *
* [ABORT]                                                                   *
*  \___/                            CPASSERT failed                         *
* |                                                                      *
*  O/|                                                                      *
* /| |                                                                      *
* / \                                                    pw/pw_grids.F:804 *
*******************************************************************************
老师，这种错误是怎么回事呀？求解答

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-14 23:29:49

wzdns 发表于 2024-5-14 11:48
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD
with errorcode 1.

光凭这种信息、没具体输入输出文件，开发者也没法准确回答

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[CP2K] CP2K计算报错---CPASSERT failed