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[其它程序] OpenBabel将pqr转换成mol2文件,文件产生了但程序报错

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本帖最后由 xiaoai 于 2024-5-21 14:05 编辑

用./RESP2_ORCA_noopt.sh ATP.pdb处理小分子文件后用Multiwfn_noGUI ATP.chg
得到ATP.pqr文件。用obabel ATP.pqr -O ATP.mol2程序报错但是ATP.mol2文件产生了。请问这是什么问题,这一步是否正确?





202405202029214998..png (56.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

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ATP相关文件.zip

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发表于 Post on 2024-5-21 00:16:36 | 只看该作者 Only view this author
不要自己在标题里写难看的【obabel求助】这种标签,这次给你改了,以后注意!
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-5-21 00:21:21 | 只看该作者 Only view this author
始终直接上传文件,别贴截图,否则别人根本没法进行测试
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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