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[CP2K] 如何将cp2k从头算输出的xyz轨迹文件通过VMD导出成Gromacs的.xtc文件和.ndx文件

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求助,如何将cp2k从头算输出的xyz轨迹文件通过VMD导出成Gromacs的.xtc文件和.ndx文件。最近在学习通过gmx计算体系的angle,但不知道该如何将CP2K的输出文件转成gromacs的相关输出文件(如对于参考帧的选取与步长的差异)

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发表于 Post on 2024-6-7 18:22:52 | 只看该作者 Only view this author
参考北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)的ppt:

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