211个原子使用B97-3c方法进行AIMD计算可行性，输入文件中冻结设置疑问

zmeeyhnn · 发表于 Post on 2024-6-23 18:02:01

本帖最后由 zmeeyhnn 于 2024-6-23 18:29 编辑

想要验证几何优化所得结构是否达到稳定，所以进行AIMD计算，打算依据石墨吸附的小分子CsOH是否在几何优化的位置附近震荡来判断几何优化结果的准确性。

求助：211个原子在orca做AIMD算的动吗？

输入文件设置的有没有明显问题？

因为使用簇模型研究吸附所以固定了石墨边缘原子，在输入文件中体现在Manage_Region active Define，其后的原子序号直接使用的高斯view中红色高亮原子的序号。这些序号需不需要整体+1，因为orca中序号好像是从0 开始的？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-6-23 21:02:43

跑个1000步左右没太大问题。凡是这种“AIMD能不能跑得动”的问题，都很好自己解决：跑10步，最后5步所需时间平均一下，乘以你想跑的步数，看看需要多久，就知道了。不需要问。
序号需要加1

sobereva · 发表于 Post on 2024-6-24 02:00:06

很费劲。这种规模的体系这种问题用CP2K跑效率高得多得多
最下面两层石墨烯没有考虑的必要

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[ORCA] 211个原子使用B97-3c方法进行AIMD计算可行性，输入文件中冻结设置疑问