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[综合交流] 自由能垒计算过程中反应物构象的选用问题

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楼主
算出来的自由能垒过高(35kcal/mol),其中一个反应物A在参与反应的时候是以船式构象与反应物B形成过渡态的,而对反应物A作optfreq所得到的结构是最优的椅式构象,此时是否可以考虑把构象转变的这部分能量排除能垒计算?即先计算椅式构象-船式构象转变的能量变化,再计算船式构象-过渡态的能量变化,取后者作为能垒?

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发表于 Post on 2024-6-19 17:29:20 | 只看该作者 Only view this author
不能,后者只能代表后者这个基元反应的能垒,而不能代表总反应的能垒。参见http://sobereva.com/506
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-25 09:43:13 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-6-19 17:29
不能,后者只能代表后者这个基元反应的能垒,而不能代表总反应的能垒。参见http://sobereva.com/506

好的,谢谢老师

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