蛋白质和纤维素链在进行NVT过程中报错There is no domain decomposition for 24 ranks

雨中宇 · 发表于 Post on 2024-6-30 11:57:09

各位老师好，我想问一下我在进行NVT模拟的时候一运行nvt.mdp文件就会报这个错误，请问具体该如何改正
There is no domain decomposition for 24 ranks that is compatible with the given box and a minimum cell size of 34.1849 nm
Change the number of ranks or mdrun option -rdd or -dds Look in the log file for details on the domain decompositio

sobereva · 发表于 Post on 2024-6-30 13:55:31

参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）的ppt：

雨中宇 · 发表于 Post on 2024-6-30 14:47:16

sobereva 发表于 2024-6-30 13:55
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）的ppt：

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好的，老师我试一下

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[GROMACS] 蛋白质和纤维素链在进行NVT过程中报错There is no domain decomposition for 24 ranks