服务器跑不能同时跑多个任务问题

jlyjlysjd · 发表于 Post on 2024-7-3 18:07:43

服务器总的有4张卡，但是我提交多个任务上去，只有一个再跑，其他的会一直等待，请问这是什么原因呢？
sub.sh文件如下：
#!/bin/bash
#SBATCH -J gromacs
#SBATCH -N 1
#SBATCH -p gpu
#SBATCH --gres=gpu:1
#SBATCH --no-requeue
#SBATCH --ntasks-per-node=15
mpirun -np 1 gmx mdrun -ntomp 12 -ntmpi 1 -gpu_id 0 -deffnm eql

同时提交的时候我特意换了-gpu-id 1 还是在等待，很奇怪，是我哪里设置错了吗？

Dempey · 发表于 Post on 2024-7-3 19:39:09

你可以scontrol show job <jobid>看一下作业的申请资源情况

jlyjlysjd · 发表于 Post on 2024-7-5 19:52:15

Dempey 发表于 2024-7-3 19:39
你可以scontrol show job 看一下作业的申请资源情况

请问4块gpu上都在运行其他的程序但是都没有跑满，那有没有办法在sub.sh中调用非空GPU 运行作业呢

Dempey · 发表于 Post on 2024-7-5 20:21:34

有办法，需要在slurm.conf和gres.conf加入shard或mps资源，具体可以看官网，如果只有gpu资源，那每张卡最多只能交一个任务

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