在ubuntu系统下安装gromacs后出现itp文件不在top文件中，但实际我放进去了

cgy · 发表于 Post on 2024-7-13 17:50:06

各位老师好，本人首次在ubuntu下安装gromacs后，按照之前在windows系统中的操作方法，把itp、gro、top（文件中包含itp文件的路径home/mo）文件放入同一文件夹后打开终端进行能量最小化，命令gmx grompp -f minim.mdp -c mo.gro -p topol.top -o em.tpr -maxwarn 1,然后出现了报错Fatal error:Topology include file "home/mo/mo.itp" not found，路径没问题，请给各位老师看一下如何解决，谢谢老师。
以下是报错截图，左边终端命令报错，右上文件夹截图，右下top文件的截图

student0618 · 发表于 Post on 2024-7-13 18:22:21

本帖最后由 student0618 于 2024-7-13 18:32 编辑

if its in the current directory just use #include "mo.itp"

sobereva · 发表于 Post on 2024-7-13 19:20:20

搞不明白相对路径是怎么回事就用绝对路径
用pwd看清楚当前在什么目录、用ls看清楚当前目录下都有什么文件

cgy · 发表于 Post on 2024-7-13 19:38:14

sobereva 发表于 2024-7-13 19:20
搞不明白相对路径是怎么回事就用绝对路径
用pwd看清楚当前在什么目录、用ls看清楚当前目录下都有什么文件

好的，谢谢社长，我再继续学习一下相对路径，谢谢老师您了

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[GROMACS] 在ubuntu系统下安装gromacs后出现itp文件不在top文件中，但实际我放进去了

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