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[Lammps] 求助:想构建48个单体随机聚合,成环,形成网状聚合物长链,不知道从何下手

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本帖最后由 cpa 于 2024-11-18 13:58 编辑

我主要有以下疑问:
①如何获取data文件,我已经通过gauss优化了结构单体,并通过packmol构建了40*40*40A,48个单体的盒子
②对于in文件如果定义了class2力场参数(参考文献用的是这个)data里是否还需要写相关力场参数信息
③对于in文件里fix成键相关判定我不知道该如何编写,小于8A成键,这里每个单体需要两个成键位点聚合N-C、N-C,其中一个单体会脱落两个N
④如何设置,直至聚合物无符合成键判断

3db514fccfb201498f03a3502ba3039.png (136.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

类似这种网状结构

类似这种网状结构

097487da1b958e722acea1d931b77f7.jpg (173.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

结构单体

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发表于 Post on 2024-11-18 10:09:46 | 只看该作者 Only view this author
别自己手写【lammps】这种标签。这次给你改了,以后注意!
该写在帖子内容里的文字不要只出现在帖子标题里
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-11-18 12:21:25 | 只看该作者 Only view this author
谢谢提醒

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