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[VMD] 求助:在保存文件时出现了错误

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楼主
具体:
在定义水盒子的时候报错something is wrong in the coordinate formatting of file system_soltest.gro. Note that gro is fixed format (see the manual).
查找得知是gro文件格式的问题,根据sob老师的方法把gro载入VMD,再保存成gro文件
尝试通过VMD打开文件,但在保存的时候,VMD报错error writing trajectory file
请问各位老师应该怎么解决该问题?


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发表于 Post on 2021-10-27 20:27:33 | 只看该作者 Only view this author
你先确保gro文件内容是正常的、符合格式要求的,再载入VMD。不清楚标准格式就随便找个gro对照着看。

确保用的是VMD 1.9.3
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-28 21:06:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-10-27 20:27
你先确保gro文件内容是正常的、符合格式要求的,再载入VMD。不清楚标准格式就随便找个gro对照着看。

确 ...

感谢sob老师!

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发表于 Post on 2024-8-27 13:54:04 | 只看该作者 Only view this author

最近我遇到了类似的问题,我用VMD画了一个石墨烯结构,含30000个原子,在保存的时候VMD报错:error writing trajectory file. 我换了个U盘保存就好了,个人觉得这个报错的原因可能是磁盘空间不够。

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