G16 C.01 有机分子的opt+freq任务闪退

AndrewX

输入文件和log末尾如图所示，计算莫名exit，共提交6个任务，全部exit，换成一个个提交也只有一个任务正常结束，剩下的都是中途exit，求老师解惑。

zjxitcc

（1）如果用的是64位Gaussian软件，内存和核数要合理指定，例如32核64GB（视机器配置实际情况而定）。不要像用32位Gaussian那样抠抠搜搜，4核4GB也太少了。
（2）输入文件写#p，而非#。
修改完后，提交1个任务，若有报错，截图报错信息来提问。

AndrewX

zjxitcc 发表于 2024-9-9 14:20
（1）如果用的是64位Gaussian软件，内存和核数要合理指定，例如32核64GB（视机器配置实际情况而定）。不要 ...

老师您好，机器配置为 24核140GB内存，按您说的，修改后的输入和输出如图

zjxitcc

AndrewX 发表于 2024-9-9 15:14
老师您好，机器配置为 24核140GB内存，按您说的，修改后的输入和输出如图

不要抠门，如果这台机器只有你一个人用，只有1个任务在跑，应该24核140GB内存全部占用。既然已经提交那就算了，目前输出内容看起来没有问题，正在计算中。

AndrewX

zjxitcc 发表于 2024-9-9 15:28
不要抠门，如果这台机器只有你一个人用，只有1个任务在跑，应该24核140GB内存全部占用。既然已经提交那就 ...

老师，并没有在计算中，截图时已经exit了，另外还有问题想请教老师，机器是租的上海超算，我是普通账户，用webV*N的方式登录命令行提交任务，一开始是没办法提交任务，然后工程师让输入以下命令：
export g16root=/public/home/users/jxcc001
export GAUSS_SCRDIR=/public/home/users/jxcc001/scratch
source ~/g16/bsd/g16.profile
后来发现每次登录都要输入一次才能提交任务，这就很蛋疼了，这个难道不是root用户在.bashrc里输一下的事吗？

zjxitcc

AndrewX 发表于 2024-9-9 16:07
老师，并没有在计算中，截图时已经exit了，另外还有问题想请教老师，机器是租的上海超算，我是普通账户， ...

如果任务很快就停止，应该尽量保留报错信息，比如屏幕上是否有报错信息，高斯log文件里是否有报错信息，队列系统是否有日志文件。没有报错信息=大家在一起瞎猜，猜到猴年马月。

如果不确定任务是否已经停止了，可以运行ps aux|grep $USER查看是否有相应的进程（注意此命令仅适用于计算任务提交至当前节点进行计算 然后查询进程。若计算任务是提交到集群队列，每种队列有相应的查询任务方式）。

你可以在自己的~/.bashrc文件里写Gaussian环境变量。

乐平

AndrewX 发表于 2024-9-9 16:07
老师，并没有在计算中，截图时已经exit了，另外还有问题想请教老师，机器是租的上海超算，我是普通账户， ...

既然你是用命令行来提交任务，那应该有提交任务的脚本才对

这些

1. export g16root=/public/home/users/jxcc001
   
2. export GAUSS_SCRDIR=/public/home/users/jxcc001/scratch
   
3. source ~/g16/bsd/g16.profile

复制代码

直接写到提交任务的脚本里，不要写到 ~/.bahsrc 里