求助氨基酸衍生物有机小分子凝胶的模拟

science_6 · 发表于 Post on 2025-3-15 21:24:32

想请教一下大家，我在做一种氨基酸衍生物有机小分子凝胶的模拟，想法是这样的：研究不同侧链对在同种溶剂下的聚集程度，可是这样做的话，在盒子体积以及凝胶因子数目不变的情况下，只有溶剂的数目进行改变，这样做跑出来的数据是否可以用来做对比？（又或者说盒子体积，凝胶因子以及溶剂数目都不变，但是我又不确定这样做是否合理）。

student0618 · 发表于 Post on 2025-3-15 21:56:40

想比较的是侧链identity还是小分子浓度？

science_6 · 发表于 Post on 2025-3-15 22:14:09

student0618 发表于 2025-3-15 21:56
想比较的是侧链identity还是小分子浓度？

这种不同侧链跑出来的结果的可以相互之间比较回转半径，氢键数目吗？

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[GROMACS] 求助氨基酸衍生物有机小分子凝胶的模拟

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