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[GROMACS] 关于拉氏图的多肽二级结构问题

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如图是三肽结构和跑gmx rama的结果,为什么跑出来没有数据呢❓是什么原因呢❓

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图片1.png

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图片3.png

rama.xvg

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发表于 Post on 2024-9-9 23:41:11 | 只看该作者 Only view this author
有没有报错?输入文件用了甚么?xtc 正确文件名称是甚么?
-f md whole.xtc 中间不会是个空格吧?
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-13 20:23:14 | 只看该作者 Only view this author
没有报错,gmx rama -s md.tpr -f md_whole.xtc -o rama.xvg这是计算用到的命令和文件名称

md.tpr

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