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[GROMACS] 54A7力场中两原子之间存在范德华作用的范围如何计算

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楼主
各位老师和同学,我想请教一下我体系有一个铁表面和一个有机小分子(约68个原子),然后这个分子吸附到了表面,现在我要确定表面与分子存在范德华力作用的范围来定义此距离内的分子吸附在表面,这个范德华力作用范围应该如何确定呢,搜出来范德华作用范围一般是0.3-0.5nm,这个取值是如何得到的呀,铁原子和碳原子之间存在范德华力作用范围也可以参考这个吗?恳请各位老师同学指导一下。非常感谢。

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发表于 Post on 2024-9-20 18:54:27 | 只看该作者 Only view this author
54A7力场根本没法模拟金属表面,前提就是错的
范德华作用随距离r以1/r^6行为衰减,所以衰减是非常快的,作用上限在哪取决于实际研究什么。诸如跑分子动力学模拟,一般至少截断到8埃,通常10埃。
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