Zn离子溶剂化结构配位数量问题

linyushuang · 发表于 Post on 2024-9-24 17:02:02

请问下大家，我在进行AIMD模拟的时候，Zn离子第一层溶剂化结构会在长时间（十几PS）内维持5配位结构，也就是Zn离子周围有五个H2O。但是我在看他们文献上用经典力学做出来的动力学轨迹一般是Zn周周有六个H2O与Zn离子配位。想请教下大家，是什么原因导致了这个变化的不同，我模拟过很多种化学环境下的Zn离子，基本都不会一直维持六个H2O配位的情况，是AIMD和经典力学MD的区别导致的吗？

ultramanm87 · 发表于 Post on 2024-9-24 23:54:30

我之前用orca优化6配位也不稳定，有文献说大部分是四配位，你参考下：
https://doi.org/10.1002/0470862106.ia260

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[综合交流] Zn离子溶剂化结构配位数量问题

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