高斯输入文件中的geom=connectivity有什么用？

暖玉生烟

最近优化同一个物质，因为之前一直把geom=connectivity和最后的那些数字都删掉了    也没在意     今天偶然听说geom=connectivity可以不删，所以就保留了geom=connectivity和最后的数字，但是输出文件相差好多，尤其是偶极矩、HOMO、LUMO及一些元素的电荷相差的实在是不能忽略。 看了一下，两个都收敛，个人想知道那种计算是比较官方的，或者说更准确的？计算化学界的沫沫，在此恳求大神帮帮忙感激不尽！！拜托~~~

暖玉生烟

图片1是删掉geom=connectivity的结果，图片2是未删掉geom=connectivity的结果

小范范1989

当时一个实行和我说的，不一定对，你看看

sobereva

连接关系的设定原理上并不会影响量化的计算结果。geom=connectivity留不留它都一样。仅对于分子力学计算连接关系是必须的。
即便输入文件相同，跑两次结果也可能不同。应该先对比最后得到的结构、能量相差多少。可能只是因为数值巧合收敛到了不同极小点上。

sobereva

小范范1989 发表于 2015-7-14 21:56
当时一个实行和我说的，不一定对，你看看

写了geom=connectivity就会从输入文件末尾读取连接关系，所以末尾那一堆连接关系不能删，否则必报错。

没写geom=connectivity时末尾的连接关系可保留也可以不保留，保留了也不会被读取。但是，如果你的计算任务牵扯到从末尾读取其它额外信息，比如基组信息、溶剂设定、输出的wfn文件路径等等，就必须把连接关系删掉，否则那些设定将没法正常读取。

暖玉生烟

小范范1989 发表于 2015-7-14 21:56
当时一个实行和我说的，不一定对，你看看

我是全删了

暖玉生烟

sobereva 发表于 2015-7-14 23:32
连接关系的设定原理上并不会影响量化的计算结果。geom=connectivity留不留它都一样。仅对于分子力学计算连 ...

能量相差很少，那我计算到底保留不保留geom呢

vegetable

我记得我试过删除和未删除两种，优化出来的构型还是会有所不同，直接体现在后续激发态计算和优化激发态计算上有一定的差距，虽然差距不是很大，如sob所说可能收敛到了两个不同的能量最小点，应该问题不大，不过我都是不保留的。

暖玉生烟

vegetable 发表于 2015-7-15 10:46
我记得我试过删除和未删除两种，优化出来的构型还是会有所不同，直接体现在后续激发态计算和优化激发态计算 ...

我之前一直不保留，后来被告知可以保留，感觉每次都删好麻烦，这次又都保留了

小范范1989

sobereva 发表于 2015-7-14 23:37
写了geom=connectivity就会从输入文件末尾读取连接关系，所以末尾那一堆连接关系不能删，否则必报错。

...

嗯，明白了，谢谢sob老师的指点

小范范1989

暖玉生烟 发表于 2015-7-15 08:20
我是全删了

我看你的名字是:暖玉生烟，哈哈。我舍友他女朋友叫玉暖，哈哈哈

暖玉生烟

小范范1989 发表于 2015-7-15 18:57
我看你的名字是:暖玉生烟，哈哈。我舍友他女朋友叫玉暖，哈哈哈

我的意义不在他女朋友

暖玉生烟

vegetable 发表于 2015-7-15 10:46
我记得我试过删除和未删除两种，优化出来的构型还是会有所不同，直接体现在后续激发态计算和优化激发态计算 ...

一般情况下，我说一般哈，加和不加geom哪个的优化结果更可靠一点点

sobereva

暖玉生烟 发表于 2015-7-15 20:09
一般情况下，我说一般哈，加和不加geom哪个的优化结果更可靠一点点

没有可靠或者不可靠之说，都一样，不影响结果

暖玉生烟

sobereva 发表于 2015-7-15 23:03
没有可靠或者不可靠之说，都一样，不影响结果

可是我用两种计算得出的结果，就最终能量一样，其他的好多参数都是不一样的现在不知道选哪个好一点