计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 790|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 对氧气分子进行结构优化的方式求助

[复制链接 Copy URL]

20

帖子

0

威望

305

eV
积分
325

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
老师们好,我想对氧气分子进性结构优化,我有两个想法,(1)首先通过gauss view建模,将盒子大小设为15*15*15,用multiwfn将自旋多重度设为3,K点仅考虑gamma点,设为只优化坐标
(2)在gauss view建模,不主动去设盒子大小,可以看到他给的大小是2.21*1*1,然后在multiwfn里将自旋多重度设为3,k点设为5,10,10,设为优化坐标与晶胞,这两个哪个能优化出正确的氧气分子结构呢。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120160

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-9-27 23:48:08 | 只看该作者 Only view this author
gview画出O2结构,保存成gjf,载入Multiwfn,进入CP2K输入文件创建界面,周期性设none,自旋多重度设-3,恰当选择理论方法和基组,产生输入文件,就完了
孤立体系设什么k,单分子优化什么晶胞,缺乏基本常识
对CP2K不很懂的情况不建议自己设置盒子,一律用Multiwfn给你设的,否则要么浪费要么太小。

另外,孤立体系的计算在北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)的“能量的计算及相关问题”的“低维体系的计算”部分有很详细讲授,尤其是盒子尺寸和psolver的选取,都是这类体系正确计算的非常关键的要点。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

20

帖子

0

威望

305

eV
积分
325

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-28 05:43:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-27 23:48
gview画出O2结构,保存成gjf,载入Multiwfn,进入CP2K输入文件创建界面,周期性设none,自旋多重度设-3,恰 ...

谢谢社长

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 15:00 , Processed in 0.162495 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list