请教关于zeo++软件计算孔径分布的问题

liyuqing

我想问一下zeo++要求的输入的结构有什么要求吗，我看到消息说不能有游离的原子；
我看到有文献是，跑粗粒化分子动力学模拟，对拉伸过程中网络结构进行孔径分布的计算，
但是当我用zeo++计算的时候孔径普遍偏小，并且当拉伸到有明显的大空洞的时候，计算的孔径分布也是明显小的，与我看到的对不上
是不是有什么限制啊，谢谢大家