计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 404|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 在分析作用力时,发现HPO3的氧和Gly的羰基氧形成键,想知道这是哪种键呢?

[复制链接 Copy URL]

95

帖子

0

威望

331

eV
积分
426

Level 3 能力者

本帖最后由 Willow0114 于 2024-10-11 14:47 编辑

如图所示,图中左上角是HPO3中的一个氧,它与GLY形成了一些键,黄色是形成的水桥和氢键,但剩下的一个紫色连接的HPO3中的氧和GLY羰基中的氧,距离是3.5埃,但我不明白这属于哪种作用力类型,还请各位老师指教。(我是通过点击HPO3,然后A-find-polar contacts-to other atom in object找到这些作用键的)

object.pdb

235.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

因为上传限制,模型删除了水分子

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120141

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-10-11 19:42:17 | 只看该作者 Only view this author
没有什么特殊的作用,纯粹是因为旁边形成了氢键,碰巧挨得比较近而已,不要过度解释。只不过存在范德华作用和静电互斥作用而已
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

95

帖子

0

威望

331

eV
积分
426

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-11 20:15:08 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢sob老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 21:58 , Processed in 0.159993 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list