vmd中xyz格式显示盒子

413 · 发表于 Post on 2014-12-30 15:06:03

如题，在vmd中怎么显示xyz格式的盒子？？
在require完pbctools后
我输入pbc set {10.0 10.0 10.0} -all后，一切正常，跳到下一命令输入行。但。。。
我输入pbc box后刷屏
-error Suspicious pbc side length (a=0.000000 b=0.000000 c=0.000000). Have you forgotten to set the pbc parameters?
-error Suspicious pbc side length (a=0.000000 b=0.000000 c=0.000000). Have you forgotten to set the pbc parameters?
-error Suspicious pbc side length (a=0.000000 b=0.000000 c=0.000000). Have you forgotten to set the pbc parameters?
....................

413 · 发表于 Post on 2014-12-30 15:18:13

vmd版本：1.9.1 win32

sobereva · 发表于 Post on 2014-12-30 16:05:06

pbctools本身就自带
你的输入没问题，之后运行pbc get看一下是否盒子确实设好了

413 · 发表于 Post on 2014-12-30 16:21:32

sobereva 发表于 2014-12-30 16:05
pbctools本身就自带
你的输入没问题，之后运行pbc get看一下是否盒子确实设好了

get之后根据输出应该是没设好
输出为：
{0.0 0.0 0.0 90.0 90.0 90.0} 什么情况？？？
vmd手册也显示这么做没问题啊
Syntax
pbc set cell [options. . . ]

sobereva · 发表于 Post on 2014-12-30 16:35:49

如果轨迹小，压缩下直接发出来看看

archer · 发表于 Post on 2020-9-9 11:34:24

遇到同样的问题，等vmd把轨迹加载完就行了

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[VMD] vmd中xyz格式显示盒子

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