求助gromacs中使用grompp指令在md中无法得到tpr文件，gromacs软件也不报错

不想延毕 · 发表于 Post on 2024-3-6 14:44:36

本帖最后由不想延毕于 2024-3-6 14:44 编辑

如图，利用charmm-gui建立的膜体系，在执行能量最小化以及nvt,npt的过程都能正常进行，在利用grompp命令整合参数时出现了这种情况，执行了几个步骤后就自动中断并让我重新输入命令，对应文件夹也没用生成tpr文件，gromacs也没有报错。想知道出了什么问题

sobereva · 发表于 Post on 2024-3-6 14:59:43

用linux版再试。Windows系统可以用vmware虚拟机装linux

牧生 · 发表于 Post on 2024-3-6 15:05:07

考虑把中文路径改成全英文，且没有空格，没有符号的路径

不想延毕 · 发表于 Post on 2024-3-6 16:00:08

牧生发表于 2024-3-6 15:05
考虑把中文路径改成全英文，且没有空格，没有符号的路径

改全英文路径也没有解决问题，准备试试linux系统

不想延毕 · 发表于 Post on 2024-3-6 16:00:35

sobereva 发表于 2024-3-6 14:59
用linux版再试。Windows系统可以用vmware虚拟机装linux

谢谢sob佬，我去研究研究

lyZhu · 发表于 Post on 2024-10-20 21:46:18

你好，我遇到同样问题，解决方案如下：使用2018cpu版本来grompp，再回到2020gpu版本来计算即可。

tip：1。高版本能兼容低版本，但注意力场里的参数要同步到cpu版本中去。2.我cpu版本从未出现上述问题，但gpu版本屡屡出现grompp后无输出问题。

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[GROMACS] 求助gromacs中使用grompp指令在md中无法得到tpr文件，gromacs软件也不报错