计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 93|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] CP2K中NEB计算任务不到10分钟便会自动停止,请问该如何解决

[复制链接 Copy URL]

21

帖子

0

威望

165

eV
积分
186

Level 3 能力者

本帖最后由 THY 于 2024-10-28 16:46 编辑

各位老师,本人使用学校超算练习NEB计算,一共插入了8个点(包含初态,末态),使用的是对角化方法,但是任务总是在几分钟后报错停止,请问该如何解决?

PS1:想请大佬帮忙看看inp文件有没有问题?
PS2:此外,若改用OT方法的话,则无报错,但是计算速度十分缓慢,24小时才完成了一步,这又是为啥呢?

注:学校超算提供的练习核数一共16个核数,96G的内存



2.xyz (7.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 1) 3.xyz (7.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)


4.xyz (7.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

5.xyz (7.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 0) 6.xyz (7.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

7.xyz (7.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 0) A.inp (13.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

A.xyz (7.54 KB, 下载次数 Times of downloads: 0) B.xyz (7.54 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)




202410281632275941..png (41.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202410281632275941..png

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-10-28 18:15:54 | 只看该作者 Only view this author
这种事一律先看副本的out文件末尾找原因
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

21

帖子

0

威望

165

eV
积分
186

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-28 21:58:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-10-28 18:15
这种事一律先看副本的out文件末尾找原因

老师,这种计算不超过20分钟就自动停止的情况,副本文件没有记录任何信息,是空的文件,没法上传,如图片所示,还有一个A-r-0.out文件已上传

202410282158438645..png (24.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202410282158438645..png

A-r-0.out

19.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2024-10-28 23:25:54 | 只看该作者 Only view this author
不可能计算了20分钟副本文件里什么都没有
光凭这些没法判断。也可能运行环境异常
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

21

帖子

0

威望

165

eV
积分
186

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-29 09:44:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-10-28 23:25
不可能计算了20分钟副本文件里什么都没有
光凭这些没法判断。也可能运行环境异常

老师,像遇到这种报错,一般是什么原因呢?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2024-10-29 21:40:21 | 只看该作者 Only view this author
THY 发表于 2024-10-29 09:44
老师,像遇到这种报错,一般是什么原因呢?

这种提示没有提供有效信息
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

179

帖子

0

威望

1494

eV
积分
1673

Level 5 (御坂)

7#
发表于 Post on 2024-10-30 08:21:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yaoyuan0711 于 2024-10-30 10:49 编辑

看看每个副本的out文件

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 10:21 , Processed in 0.180033 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list