计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 4371|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 求助关于CP2K Data directory path路径更改问题

[复制链接 Copy URL]

30

帖子

0

威望

213

eV
积分
243

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
我是在现有的服务器上使用CP2K计算,尝试了一个例子,输出文件显示
CP2K| Program compiled at                          Wed Apr 12 10:32:25 CST 2017
CP2K| Program compiled on                                                  mn01
CP2K| Program compiled for                              Linux-x86-64-intel-host
CP2K| Data directory path    /home/chenqw3/BUILDROOT/cp2k-source/cp2k-build-201


*******************************************************************************
*   ___                                                                       *
*  /   \                                                                      *
* [ABORT] The specified OLD file <GTH_BASIS_SETS> cannot be opened. It does *
*  \___/                     not exist. Data directory path:                  *
*    |      /home/chenqw3/BUILDROOT/cp2k-source/cp2k-build-20170327-popt/data *
*  O/|                                                                        *
* /| |                                                                        *
* / \                                                   common/cp_files.F:393 *
*******************************************************************************

大佬们,‘/home/chenqw3/BUILDROOT/cp2k-source/cp2k-build-20170327-popt/data’, 这个路径可以更改吗,怎样更改?谢谢各位大佬。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2022-1-18 20:37:23 | 只看该作者 Only view this author
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html

为什么设CP2K_DATA_DIR环境变量这里说一下。在CP2K输入文件中,如果诸如BASIS_SET_FILE_NAME、POTENTIAL_FILE_NAME等关键词只定义了文件名而没有给路径,程序默认先在当前目录下搜索相应文件,找不到的话去CP2K_DATA_DIR搜索。CP2K_DATA_DIR对应的是编译的时候CP2K目录下的data目录的路径,但开发者在编译的时候其对应的路径显然跟我们当前情况不符,因此这里通过export来将CP2K_DATA_DIR环境变量改成自己机子里实际的data目录的路径。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

30

帖子

0

威望

213

eV
积分
243

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-19 08:35:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-18 20:37
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586(http://bbs.keinsci.com/thread-2 ...

感谢sob大佬

57

帖子

0

威望

2028

eV
积分
2085

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2024-10-6 06:41:18 | 只看该作者 Only view this author

您好!
我运行官方的预编译版CP2K,出现类似错误信息:

GENERATE|  Preliminary Number of Bonds generated:                             0
GENERATE|  Achieved consistency in connectivity generation.

*******************************************************************************
*   ___                                                                       *
*  /   \                                                                      *
* [ABORT]                                                                     *
*  \___/  The specified OLD file <BASIS_MOLOPT> cannot be opened. It does not *
*    |      exist. Data directory path: /home/gridsan/cdeng/cp2k-2024.2/data  *
*  O/|                                                                        *
* /| |                                                                        *
* / \                                                   common/cp_files.F:396 *
*******************************************************************************


===== Routine Calling Stack =====

            3 read_qs_kind
            2 create_qs_kind_set
            1 CP2K

Program received signal SIGABRT: Process abort signal.


我自己也看了Sob老师的回复,还是搞不明白,data文件夹要我们自己建个空的吗?请问您是怎么解决的呢,谢谢!      

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112349

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2024-10-6 07:46:57 | 只看该作者 Only view this author
chunlinxxx 发表于 2024-10-6 06:41
您好!
我运行官方的预编译版CP2K,出现类似错误信息:

下载源代码包,解压,再把可执行文件放进去,并按我的博文配置环境变量,要不然CP2K不知道data目录在哪。源代码包里有data目录
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

57

帖子

0

威望

2028

eV
积分
2085

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2024-10-6 09:47:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-10-6 07:46
下载源代码包,解压,再把可执行文件放进去,并按我的博文配置环境变量,要不然CP2K不知道data目录在哪。 ...

谢谢老师。我找到源代码包里面的data目录了,现在运行正常

1

帖子

0

威望

11

eV
积分
12

Level 1 能力者

7#
发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
chunlinxxx 发表于 2024-10-6 09:47
谢谢老师。我找到源代码包里面的data目录了,现在运行正常

你好我想问一下这个源代码在哪里找的呀

57

帖子

0

威望

2028

eV
积分
2085

Level 5 (御坂)

8#
发表于 Post on yesterday 01:17 | 只看该作者 Only view this author
粥粥呀 发表于 2024-11-20 14:42
你好我想问一下这个源代码在哪里找的呀

就在Github网站上文件包

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 05:22 , Processed in 0.168794 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list