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[综合交流] 跑AIMD时平衡相阶段和产生相阶段的步长是否要一致

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由于我跑的AIMD体系要考察氢原子的转移,因此在产生相阶段的步长准备设为0.5fs。那平衡相阶段是否也一定要把步长设为0.5fs呢?因为我设为0.5fs时平衡阶段就发生了氢的转移,可否设为1fs来跑平衡阶段?

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发表于 Post on 2024-11-18 10:31:01 | 只看该作者 Only view this author
这种问题根本不该分为平衡相和产生相,直接跑一次MD就完了。不要以为什么问题都有平衡相和产生相的概念
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-11-18 12:36:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-11-18 10:31
这种问题根本不该分为平衡相和产生相,直接跑一次MD就完了。不要以为什么问题都有平衡相和产生相的概念

sob老师主要是我看到文献里会限制键长来把各个参数跑平衡再探究化学反应,因此我把会发生反应的过氧键长限制了,但是发现跑平衡的过程中H-O键也会断裂。所以才有这个疑问

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发表于 Post on 2024-11-18 13:29:16 | 只看该作者 Only view this author
ljh123 发表于 2024-11-18 12:36
sob老师主要是我看到文献里会限制键长来把各个参数跑平衡再探究化学反应,因此我把会发生反应的过氧键长 ...

平衡相过程中把H-O键长约束住就完了
确信不发生反应的过程步长用不着0.5fs那么小
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