求助，聚合物塑料粒子模型加水后模拟报错的问题？

zyp1999

求助各位大佬，我前期用packmol建了sds包围的MMA粒子模型（图1），让它在水中跑完5ns的md之后提取出了sds+MMA的粒子构型，想复制几个之后再重新加水，组成体系（图2）去跑后续的过程。但是重新加完水之后就报错了，我试了把粒子附近的水去除，选取距离sds和MMA一定距离之外的水（sameresidue as {water not within 15 of resname MMA SDS}），也依旧报错，我猜测是存在一些不合理的接触，但是具体不知道如何处理，该怎么解决？

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楼主是在做疏水模拟吗，最近在了解这块内容想了解下是怎么做到的，