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[GROMACS] 求助,怎样自定义sobtop生成gromacs 57A4&CHARMm36的.top文件?

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求助,怎样自定义sobtop生成gromacs 57A4&CHARMm36的.top文件?有实现过的大佬吗?

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发表于 Post on 2024-4-20 09:05:03 | 只看该作者 Only view this author
没法自定义,好好看http://sobereva.com/soft/Sobtop/#FAQ2,而且根本不存在叫gromacs 57A4的东西

若无特殊情况,生物分子一律用AMBER力场。
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Money and papers are rubbish, get a real life!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-20 22:40:20 | 只看该作者 Only view this author
好的谢谢!受教了社长!

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发表于 Post on 1 hour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-20 09:05
没法自定义,好好看http://sobereva.com/soft/Sobtop/#FAQ2,而且根本不存在叫gromacs 57A4的东西

若无 ...

老师您好,我在跑油水两相模拟,我的小分子都是使用sobtop程序生成的,但现在老板需要添加壁面,使用charmm-gui网站生成的力场文件在defaults这一项中和AMBER立场参数不一样,我能否通过什么方法来将他们统一起来呢?

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