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[GROMACS] 蛋白质与小分子对接后的动力学模拟,在进行能量最小化时报错

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在进行蛋白质与小分子对接后的动力学模拟,在能量最小化过程中出现了这个报错,该怎么解决?
Fatal error:There is no domain decomposition for 128 ranks that is compatible with thegiven box and a minimum cell size of 1.86156 nmchange the number of ranks or mdrun option -rdd or -dds
Look in the log file for details on the domain decomposition

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发表于 Post on 2024-12-6 01:27:33 | 只看该作者 Only view this author
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX)的ppt:
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-6 09:26:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-6 01:27
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/KGMX)的ppt:

感谢sobereva老师,解决了

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