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[CP2K] 求助,cp2k振动分析的泛函选择问题

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大家好,我在使用cp2k对晶胞进行振动分析时(VIBRATIONAL_ANALYSIS),采用B3LYP 6-311G**产生的out文件在multiwfn上不能绘制出红外谱图,但是采用cp2k默认的DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组产生的out文件却可以绘制红外谱图,请问一下这是什么原因。(因为计算单分子采用了B3LYP 6-311G**,想用同样的基组做对比,不过DZVP-MOLOPT-SR-GTH确实很好用,计算速度比前者高很多)

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发表于 Post on 2021-9-8 15:20:27 | 只看该作者 Only view this author
你标题和内容问的不是一个问题,“采用cp2k默认的DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组”的时候,你用的泛函是哪个?
另外检查B3LYP计算的输出文件有没有正常结束,有没有振动频率、红外强度信息。问问题之前应该先自己尝试分析问题,自己搞不定再来问,别把cp2k的输出文件当成黑箱子,拿Multiwfn读不出来就来问为什么,应该自己打开输出文件看一下
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-9-9 01:30:10 | 只看该作者 Only view this author
“不能绘制出红外谱图”这种描述没有任何信息量,说清楚怎么不能,并且上传压缩后的输出文件
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-11 15:01:10 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-9-8 15:20
你标题和内容问的不是一个问题,“采用cp2k默认的DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组”的时候,你用的泛函是哪个?
另 ...

好的,确实应该,我先自己尝试分析一下,受教了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-15 10:30:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-9-9 01:30
“不能绘制出红外谱图”这种描述没有任何信息量,说清楚怎么不能,并且上传压缩后的输出文件

老师好,我又重新做了一遍,不能绘制图谱的具体表现为:输入选项(1:IR)之后闪退,文件中以B3LPY命名的文件可以绘制出纵轴,无数据,GTH-PBE命名的文件闪退。一个晶胞结构中只有一个分子的文件命名为one.out,一个晶胞中有四个分子的命名为four.out,两个文件除了晶胞信息外完全相同,但晶胞中仅有一个分子的可以绘制谱图,有四个分子的则不行(四个文件使用的都是同一个物质)希望老师能指点一下看哪里出现了错误,感谢

a.zip

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发表于 Post on 2021-9-16 07:15:21 | 只看该作者 Only view this author
beaveror 发表于 2021-9-15 10:30
老师好,我又重新做了一遍,不能绘制图谱的具体表现为:输入选项(1:IR)之后闪退,文件中以B3LPY命名的文 ...

B3LYP那个任务根本没算完,一看输出文件末尾就知道

four.out里有很多数据异常,比如84543行的频率都是星号,Multiwfn没法读取,仔细检查输入文件的合理性
VIB|                       250                  251                  252
VIB|Frequency (cm^-1) ************         ************         ************

GTH-PBE也有很多频率是星号无法读取,77385行
VIB|Frequency (cm^-1) ************         ************         -9745.706894

要么计算设置不合理,要么结构没在当前级别优化过
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发表于 Post on 2025-2-23 16:22:10 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 做一头安静的猪 于 2025-2-28 16:24 编辑
sobereva 发表于 2021-9-16 07:15
B3LYP那个任务根本没算完,一看输出文件末尾就知道

four.out里有很多数据异常,比如84543行的频率都是 ...

你好,频率是*号的问题解决了吗?请问是怎么解决的
----------------------------后续----------------------------------
不好意思,发错位置了。
分享一下后续,input中统一一下精度,还有固定无关原子,输出为****的问题就解决了。

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发表于 Post on 2025-2-23 17:03:19 | 只看该作者 Only view this author
做一头安静的猪 发表于 2025-2-23 16:22
你好,频率是*号的问题解决了吗?请问是怎么解决的

回复我的帖子做什么,明明是楼主的问题
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