几何优化后出现异常结构，二氟磷酸锂的锂与多个原子进行成键

wwwwwt · 发表于 Post on 2024-12-23 13:34:03

本帖最后由 wwwwwt 于 2024-12-25 10:26 编辑

请问各位老师，优化后几何结构异常是怎么回事？理应锂离子与氧形成离子键，而图中二氟磷酸锂的锂与多个原子进行成键。
这一问题在将电荷数改为1去优化时（本人实验需要），就得到正常的结构。
左图是异常结构，右图是电荷数为1的正常结构，第一个文件是异常结构的.out文件，第二个是电荷数为1的正常结构.out文件

LiF2PO2.gjf_%j (4).out (234.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

zheng1LiF2PO2gas.gjf_%j (1).out (283.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2024-12-23 13:42:00

本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2024-12-25 11:11 编辑

从“理应锂离子与氧形成离子键”这句开始就有问题了。二氟磷酸锂是什么状态与体系密切相关，晶体、溶液、气态都不一样，取决于研究课题。孤立体系和周期性体系的建模和计算差异明显，先把这问题确认再说是否“异常”。

（另外我实在好奇，这段文字究竟是在哪个编辑器写完以后带格式复制粘贴过来的，这种(0,144,0)深绿色背景已经见过好多次了……编辑：已移除，但是暂时找不到先例）

wwwwwt · 发表于 Post on 2024-12-23 13:54:27

谢谢您，首先我想得到的是二氟磷酸锂气相下、不考虑溶剂模型的情况下的几何优化，是孤立体系；其次，我是第一次发帖，前面一致说我内容不合法，无法发帖，我索性就复制粘贴别人的贴子再修改，抱歉
追问：请问第一个图中的结构在某种体系或者状态下是合理的吗？

xuyangsyo · 发表于 Post on 2024-12-23 15:50:09

Gaussian的out文件不包含成键信息，键连关系是根据原子间距自动生成的，参考（http://sobereva.com/414）。图一的结构没有问题，二氟磷酸根与锂原子螯合是合理结构。加上电荷之后正点中心排斥导致磷-锂间距增大，无法螯合，自然形成了你所说的“正常”结构。

sobereva · 发表于 Post on 2024-12-23 15:50:29

wwwwwt 发表于 2024-12-23 13:54
谢谢您，首先我想得到的是二氟磷酸锂气相下、不考虑溶剂模型的情况下的几何优化，是孤立体系；其次，我是第 ...

重新编辑帖子，免得影响别人阅读

wwwwwt · 发表于 Post on 2024-12-25 10:25:25

xuyangsyo 发表于 2024-12-23 15:50
Gaussian的out文件不包含成键信息，键连关系是根据原子间距自动生成的，参考（http://sobereva.com/414）。 ...

感谢！

wwwwwt · 发表于 Post on 2024-12-25 10:25:48

sobereva 发表于 2024-12-23 15:50
重新编辑帖子，免得影响别人阅读

好的

wwwwwt · 发表于 Post on 2024-12-25 13:41:11

本帖最后由 wwwwwt 于 2024-12-25 13:41 编辑

接上个帖子
我考虑了溶剂模型后，进行几何优化，分子结构与未考虑溶剂模型的几何优化不一致，请问是考虑溶剂模型后使分子结构发生变化吗？
第一图为未考虑溶剂模型, 第二图为考虑溶剂模型，
第一个文件对应第一个图的.out 第二个文件对应第一个图的.out
电荷数和自旋多重度都一致

LiF2PO2.out (215.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

LiF2PO2.gjf_%j (3).out (394.05 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-12-25 17:40:06

wwwwwt 发表于 2024-12-25 06:41
接上个帖子
我考虑了溶剂模型后，进行几何优化，分子结构与未考虑溶剂模型的几何优化不一致，请问是考虑溶 ...

这种体系必须做显式溶剂化，也就是把和Li+配位的溶剂全部画出来，再加溶剂关键词。只加溶剂关键词是不行的

wwwwwt · 发表于 Post on 2024-12-26 10:41:41

wzkchem5 发表于 2024-12-25 17:40
这种体系必须做显式溶剂化，也就是把和Li+配位的溶剂全部画出来，再加溶剂关键词。只加溶剂关键词是不行 ...

好的，感谢！

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考虑溶剂模型后分子结构不一致

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