“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 212|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 询问OpenClaw是否能实现自动化动力学模拟以及共识化标准倡议

[复制链接 Copy URL]

1

帖子

0

威望

35

eV
积分
36

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
OpenClaw盛行于能代替用户进行终端操作的便利性,而动力学模拟绝大多部分都可以通过脚本实现,所以OpenClaw是不是可以作为一个完整的动力学模拟的执行者,从小分子蛋白质建模,运行模拟,数据分析。目前clawhub上已经有一些指导智能体操作gromacs实现动力学模拟的skills,但是整个流程缺乏同行评审,是否能够实现高质量的模拟还有待验证。
所以我觉得有没有可能基于公社这个国内受欢迎的很高的社区形成一个共识性的人工智能用于模拟的操作规范?这样也有助于促进模拟的标准化和可重复性,也能让更多的研究者受益,能够使用到高质量的模拟结果来支持他们的研究工作。

989

帖子

4

威望

2326

eV
积分
3395

Level 5 (御坂)

A Student

2#
发表于 Post on 2026-3-28 00:35:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 student0618 于 2026-3-30 22:28 编辑

模拟范围太广了,大概目前只会是特定体系或工作流将现在用脚本自动化的工作用 agent跑。

因资安问题我没用OpenClaw,不过有用coding agent。自己也在写一些自动化脚本用来改作 agent 友善的skill/tool 结合自己的一套工作流,目的是某天摸鱼也没人发现(?),但还有不少除了token花光以外的问题会卡住的。

很多情况还是较难用各种common issues文件处理。写个特别详尽的markdown让agent去grep各种问题的处理方法也不是不行,但可能性还是太多。力场一换、程序换个版本加个插件又可能要加几百行处理方法的文档了。没文档上网搜解决方案的效率及准确性成疑,而且有有safety concern。
还有些具体问题,如:
  • agent用脚本分析,例如排查原子间的距离,逻辑和算法没优化好会clash或跑很慢。agent写的脚本memory leak或者用很慢的for loop算距离这种还是很常见的。
  • 卡住的也很多是参数化部分,例如力场没参数或参数不够好,某个120度的二面角跑成180度等。尤其是要搞的体系太复杂的话 (例如我在灌水板块某个吐槽帖提到的体系),还是手动做这部分算了。
以上两点可以用现有脚本作Skill的一部分来调用解决,但还是这句,实际应用太多exceptional case需要调整了。

最重要的还是按实际目的选模拟方法、分析方法,目前还需要按经验判断agent决定是否正确的。

我现在是屏幕一半审查指导Agent工作 (+看token剩多少),一半手写bash脚本及开vmd处理麻烦体系。分析用脚本加不少code sample/规范也只敢让它写脚本给我跑。不然context太多放不进去或LLM没抓住重点,脚本没优化吃太多内存的话实在吃不消。

P.S. LLM当agent 会用高风险指令如rm 的机会很大,尤其是便宜的小模型,这也是要小心的一个原因。系统禁用rm指令也有100个删文件方法的。



评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
SharkYYX2025 + 3 赞!

查看全部评分 View all ratings

敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-13 15:19 , Processed in 0.207723 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list