求助：CP2K做限制性AIMD计算自由能输入文件

wangyueda · 发表于 Post on 2022-6-23 22:33:18

本帖最后由 wangyueda 于 2022-6-23 22:33 编辑

最近看到一篇南科大王阳刚老师组在ACS Catalysis发表的文章，使用CP2K做限制性AIMD，然后通过热力学积分方法来计算化学反应过程中的自由能变化。我看了一下自由能计算部分所引用的文献，发现是Michiel Sprik 1998年发表在JCP上的一篇文章。（J. Chem. Phys. 109, 7737 (1998)）在VASP中，对应为
Slow-growth方法。(https://www.vasp.at/wiki/index.php/Slow-growth_approach)。然而CP2K官网给出的例子（https://www.cp2k.org/exercises:2 ... or_nacl_in_gasphase）我看的一知半解，所以想请问下各位老师有做过相关计算的可否
给个输入文件模板（尤其是MOTION section下COLLECTIVE和LAGRANGE_MULTIPLIERS这俩子section部分的设置），并大致说下结果处理过程，感谢感谢~

chen0201 · 发表于 Post on 2023-3-17 16:36:57

请问解决了吗？我也想学习cp2k跑MD结果中自由能变化的计算，不明白关键词的设定

lirenyi · 发表于 Post on 2023-5-23 20:05:07

有解决吗可以一起探讨一下 VASP我已经做过了但是计算效率太低了

海鸥 · 发表于 Post on 2023-12-28 16:02:50

楼主有解决吗，用cp2k计算限制性MD，算PMF;
我看官网的感觉和经典MD差不多，引入了LJ势能

1764360701 · 发表于 Post on 2024-4-14 15:44:30

chen0201 发表于 2023-3-17 16:36
请问解决了吗？我也想学习cp2k跑MD结果中自由能变化的计算，不明白关键词的设定

您好，我最近也在用cp2k搞限制性aimd，可以和您交流一下嘛

chen0201 · 发表于 Post on 2024-7-5 17:31:56

1764360701 发表于 2024-4-14 15:44
您好，我最近也在用cp2k搞限制性aimd，可以和您交流一下嘛

可以的呢

Njr. · 发表于 Post on 2024-12-28 18:55:24

chen0201 发表于 2024-7-5 17:31
可以的呢

你好可以请教一下MM部分的关键词设置吗

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