求助，Gaussian计算含碘带电体系，得不到结构图中的电荷与后续弥散基组的添加

Sunlin · 发表于 Post on 2024-12-29 11:23:09

本帖最后由 Sunlin 于 2024-12-29 11:25 编辑

各位老师同学你们好！我最近在计算图一中两个含有碘原子带电体系结构式的优化结构和homo lumo轨道能级。因gaussian只能对整个体系设置电荷，所以对A结构，电荷量设为1，对AN结构，电荷量设为0。原本打算先对非金属元素用6-311G**基组，I用def2svp基组，然后计算ADCH电荷，看负电荷集中在哪个原子上再添加弥散基组进一步优化。
然而两个体系计算出的正电荷结果，并没有如图一中所示的在N原子上出现明显+1电荷，最高仅为0.06电荷。A体系上最大负电荷为-0.55位于一个C原子上，I原子上的负电荷仅是-0.25电荷。AN体系上，I原子负电荷为-0.67电荷。因此有如下几个问题：

1 请问原子电荷与结构图不符是正常的吗？若是正常，那么对于AN体系上I原子电荷量-0.65的情况，是否可以看作负电荷集中而后续添加弥散基组进一步优化呢？假如AN添加弥散基组，那么对于A体系是否要和AN体系保持一致，而只在I原子，或在I和最大负电荷为-0.55的C原子上同时添加弥散基组进一步优化呢？l
2 体系AN优化后图二结构中的两个N原子相对位置与图一结构式中的两个N原子相对位置明显不同，请问这是什么原因，是否正常呢？

sobereva · 发表于 Post on 2024-12-29 22:50:24

别被单一Lewis式误导
参考北京科音初级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/KEQC）、北京科音中级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/KBQC）给的两个例子

Sunlin · 发表于 Post on 2024-12-29 23:21:38

本帖最后由 Sunlin 于 2024-12-29 23:23 编辑

sobereva 发表于 2024-12-29 22:50
别被单一Lewis式误导
参考北京科音初级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/KEQC）、北京科音中级量子 ...

非常感谢卢老师！我知道了，计算结果与结构式描述的电子结构不同是正常的
还有问题想请教老师您，我用def2svp极化基组计算出其中一个体系的I原子电荷为-0.67，只用极化基组优化的结果是否已经够了，若继续用弥散基组优化该原子，请问老师用哪个弥散基组更好呢？对于另一个体系中仅有-0.25的I原子，是否也要加该弥散基组保持相同性呢。

sobereva · 发表于 Post on 2024-12-29 23:29:02

Sunlin 发表于 2024-12-29 23:21
非常感谢卢老师！我知道了，计算结果与结构式描述的电子结构不同是正常的
还有问题想请教老师您，我用de ...

不存在极化基组、弥散基组这种词，仔细看
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html）

对于优化的目的，def2-SVP勉强够了，若要加弥散可以ma-def2-SVP，见
给def2以ma-方式加弥散函数的Gaussian格式的基组定义文件（含所有def2支持的元素）
http://sobereva.com/509（http://bbs.keinsci.com/thread-14370-1-1.html）

Sunlin · 发表于 Post on 2024-12-29 23:59:45

sobereva 发表于 2024-12-29 23:29
不存在极化基组、弥散基组这种词，仔细看
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/29 ...

好的，谢谢老师！

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