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[其它程序] 求助forcite分析中length distribution和RDF区别

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用于分析分子结果中2种原子之间键长的改变情况,如图1和2所示分别使用于forcite分析中的length distribution和RDF(radius distribution function)功能, 对几何优化的xtd轨迹文件进行分析,求助下大家,这两种功能对原子键长情况的分析有什么区别?

顺便想问一下,bond length分析图表中横坐标为键角,纵坐标为1/A(长度单位埃),纵坐标表示什么含义呢,是分布概率/密度的意思吗?

RDF.png (112.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

RDF

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bond length.png (152.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

Bond length

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发表于 Post on 2025-2-12 05:40:07 | 只看该作者 Only view this author
用google搜rdf的定义,弄清楚定义自然就知道怎么回事了

距离分布函数纯粹就是统计粒子间不同距离出现概率,曲线是归一化的(积分值为1,故单位自然是那样),P=probability
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-14 17:27:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-2-12 05:40
用google搜rdf的定义,弄清楚定义自然就知道怎么回事了

距离分布函数纯粹就是统计粒子间不同距离出现概 ...

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