虚频方向正确但数值过大（-1581 cm⁻¹）,非成键原子也在振动

jyl2

大家好！
[color=rgba(0, 0, 0, 0.9)]phio和F-MnⅢ（重氮卟啉配体）生成PHI和F-MnⅤ=O（重氮卟啉配体）的反应，设置自旋多重度是3重态，过渡态搜索关键词是# opt=(calcfc,ts,noeigen) freq ub3lyp scrf=(iefpcm,solvent=acetonitrile) def2svp empiricaldispersion=gd3 integral=grid=ultrafine iop(1/8=10)，完成搜索后发现只有一个虚频值为-1581，但是这个虚频值不仅对应着O的成键方向上的振动还对应着重氮卟啉配体上与锰相链接的四个氮的振动。虚频方向正确但数值过大（-1581 cm⁻¹），在GaussView中观察虚频对应的原子振动位移与预期的O成键方向一致，但是在这个虚频振动中不仅有O振动还有配体上N振动，之后我进行了IRC验证发现结构完全不行。请问各位老师这种情况怎么处理呀？

sobereva

先主动说清楚你试图研究什么反应，否则别人根本不知道你期望得到什么样的过渡态。很可能实际本来就不存在你期望的过渡态（比如纯粹的单个键的断裂过程，大多数情况根本没有过渡态；若有过渡态往往也是伴随着其它原子位置显著的变化或电子结构重排），做个柔性扫描进行检验便知（包括试图同时冻结你不希望运动的原子）。

另外，说过渡态的虚频数值大小没意义，只有虚频振动模式才是需要关心的，频率该是多大就是多大，怎么就“过大”了？

jyl2

sobereva 发表于 2025-3-7 06:45
先主动说清楚你试图研究什么反应，否则别人根本不知道你期望得到什么样的过渡态。很可能实际本来就不存在你 ...

不好意思，社长。已经修改了。哈哈。