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[Multiwfn使用咨询] multiwfn产生的molden文件用multiwfn能否绘制原子轨道的径向分布函数图

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本帖最后由 hehe 于 2025-3-19 18:46 编辑

请问Sob老师,molpro产生的molden文件用multiwfn能否绘制分子的不同原子轨道的径向分布函数图?
谢谢老师!

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发表于 Post on 2025-3-19 18:21:57 | 只看该作者 Only view this author
分子没有一般意义的原子轨道(除非是指NAO轨道之类)
如果你指具有原子轨道特征的分子轨道(如下文说的里德堡轨道),可以
图解电子激发的分类
http://sobereva.com/284http://bbs.keinsci.com/thread-840-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2025-3-19 18:49:00 | 只看该作者 Only view this author
如果你说的是那种带节点的径向分布,可以先绘制一维的径向电子密度,并保存数据文件。然后手工编辑数据,把密度值乘以球面积(如果只关心曲线形状,也可以直接乘以r^2),然后用matlab、origin画图

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-19 18:59:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-19 18:21
分子没有一般意义的原子轨道(除非是指NAO轨道之类)
如果你指具有原子轨道特征的分子轨道(如下文说的里 ...

您好老师,我更新了一下帖子。我想仿照LrF的径向分布函数图,绘制我的体系的径向分布函数图。
我的疑惑是molpro得到的.molden文件是针对于分子的,我看到您的贴子里谈到关于用高斯绘制原子的径向分布函数的方法,那么对于分子的话是不是需要将.fch文件中分子轨道分解回原子轨道,然后进行绘制呢?
还有一个问题是我用molpro得到的.molden文件利用multiwfn转换成.fch文件,进行径向分布函数的绘制是否可行呢?

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发表于 Post on 2025-3-20 04:18:35 | 只看该作者 Only view this author
hehe 发表于 2025-3-19 18:59
您好老师,我更新了一下帖子。我想仿照LrF的径向分布函数图,绘制我的体系的径向分布函数图。
我的疑惑 ...

你贴的那个图意义不明
若要从分子中还原出原子轨道,可以用Multiwfn基于NBO程序给出的NAO轨道绘制
我只能告诉你Multiwfn绘制rdf的功能对任何体系都是普适的,只要提供波函数文件就行,Multiwfn支持的波函数文件情况在下文说得非常完整,molpro的molden文件被Multiwfn直接支持
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html

另参考
电子空间范围<r^2>和电子径向分布函数的含义以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/616http://bbs.keinsci.com/thread-25075-1-1.html

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-20 09:35:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-20 04:18
你贴的那个图意义不明
若要从分子中还原出原子轨道,可以用Multiwfn基于NBO程序给出的NAO轨道绘制
我只 ...

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-20 17:50:36 | 只看该作者 Only view this author
beefly 发表于 2025-3-19 18:49
如果你说的是那种带节点的径向分布,可以先绘制一维的径向电子密度,并保存数据文件。然后手工编辑数据,把 ...

您好老师,我是想看分子中的原子轨道的在平衡核间距处的重叠情况。我用molpro计算得到的.molden文件只是一个点的波函数文件,但是我画图时应该是需要每个R处的.molden文件,我这样想对吗?如果对的话,在molpro中如何得到每个点的.molden文件呢?

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