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[CP2K] CP2K中QS模块下的Method如何选择?

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新手提问。如题,QS模块下,能选择的method非常多,这里的选择性有什么讲究吗?比如我需要用分子动力学计算有机分子在过渡金属表面的吸附,用哪一个既能有精确度也能有速度?换体系选择的方法又是什么?还请各位老师指点迷津,非常感谢!
METHOD: enum= GPW

Usage: METHOD GAPW

Valid values:

  • GAPW Gaussian and augmented plane waves method

  • GAPW_XC Gaussian and augmented plane waves method only for XC

  • GPW Gaussian and plane waves method

  • LRIGPW Local resolution of identity method

  • RIGPW Resolution of identity method for HXC terms

  • MNDO MNDO semiempirical

  • MNDOD MNDO-d semiempirical

  • AM1 AM1 semiempirical

  • PM3 PM3 semiempirical

  • PM6 PM6 semiempirical

  • PM6-FM PM6-FM semiempirical

  • PDG PDG semiempirical

  • RM1 RM1 semiempirical

  • PNNL PNNL semiempirical

  • DFTB DFTB Density Functional based Tight-Binding

  • XTB GFN-xTB Extended Tight-Binding

  • OFGPW OFGPW Orbital-free GPW method



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发表于 Post on 2023-11-2 06:24:40 | 只看该作者 Only view this author
问题太宽泛。而且诸如GPW和GAPW只是计算形式的大类,具体用的泛函、基组等因素对结果又有关键性影响。各种相关背景知识和使用在北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里有全面、深入、细致的介绍,不是这里几句话能说明白的。

至于你说的那种问题,只能告诉你通常适合以GPW形式做基于DFT的AIMD计算,PBE-D3(BJ)泛函结合DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组通常合适,性价比较高,但没更具体细节没法更准确回答。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-2 11:42:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-11-2 06:24
问题太宽泛。而且诸如GPW和GAPW只是计算形式的大类,具体用的泛函、基组等因素对结果又有关键性影响。各种 ...

谢谢Sob老师!

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发表于 Post on 2024-1-25 18:07:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-11-2 06:24
问题太宽泛。而且诸如GPW和GAPW只是计算形式的大类,具体用的泛函、基组等因素对结果又有关键性影响。各种 ...

sob老师,看CP2K手册给的参考文献,PM6-FM提及的是色散和氢键的校正版本,那么对应的是PM6-DH还是PM6-D3H4,具体是哪个版本呢?

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发表于 Post on 2024-1-26 03:13:09 | 只看该作者 Only view this author
adong 发表于 2024-1-25 18:07
sob老师,看CP2K手册给的参考文献,PM6-FM提及的是色散和氢键的校正版本,那么对应的是PM6-DH还是PM6-D3H ...

都不是。而是https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jcc.23887里提出的
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发表于 Post on 2024-1-26 10:59:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-1-26 03:13
都不是。而是https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jcc.23887里提出的

sob老师,那PM6-FM + D3 会比 PM6 + D3 校正对一般有机体系模拟效果好吗?

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发表于 Post on 2024-1-26 14:22:53 | 只看该作者 Only view this author
一般具体的应用都有相应的文献作为参考的吧

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发表于 Post on 2024-1-27 03:56:13 | 只看该作者 Only view this author
adong 发表于 2024-1-26 10:59
sob老师,那PM6-FM + D3 会比 PM6 + D3 校正对一般有机体系模拟效果好吗?

不会有什么额外优势
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发表于 Post on 2024-1-27 21:49:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-1-27 03:56
不会有什么额外优势

谢谢sob老师

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实验组内的DFT计算、第一性原理、MD模拟爱好者

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发表于 Post on 2025-3-7 00:41:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-11-2 06:24
问题太宽泛。而且诸如GPW和GAPW只是计算形式的大类,具体用的泛函、基组等因素对结果又有关键性影响。各种 ...

卢老师,我的体系约2200-2500个原子,有机聚合物和水(C\H\O\N)的体系,在cp2k中做FPMD,使用pbe搭配DZVP-MOLOPT-SR-GTH基组,64核计算。即使开OT,也很慢,体系太大,想跑个20ps。在泛函、赝式基组、体系不变且不损失结果信赖度的情况下需要怎么降低耗时呢,我看讲义中能量部分介绍了两种方法:LSSCF(<6000原子下、无优势,不如不启用)、LRIGPW方法(占用内存巨大),个人看着都不太好,老师您有什么好的建议吗
目前专攻:
基于DFT、MD模拟的自由能计算
基于过渡态理论的自由能垒和反应速率常数计算
基于MD模拟的交联聚合物计算

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发表于 Post on 2025-3-7 06:17:17 | 只看该作者 Only view this author
JCenter 发表于 2025-3-7 00:41
卢老师,我的体系约2200-2500个原子,有机聚合物和水(C\H\O\N)的体系,在cp2k中做FPMD,使用pbe搭配DZV ...

普通的计算条件下只能用GFN1-xTB或GFN0-xTB
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发表于 Post on 2025-3-7 14:38:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-7 06:17
普通的计算条件下只能用GFN1-xTB或GFN0-xTB

感谢老师
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基于DFT、MD模拟的自由能计算
基于过渡态理论的自由能垒和反应速率常数计算
基于MD模拟的交联聚合物计算

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