计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 241|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 关于配合物结构优化出现警告的问题

[复制链接 Copy URL]

42

帖子

0

威望

197

eV
积分
239

Level 3 能力者

各位老师好,我想用CP2K对于一个配合物进行结构优化,采用PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH,没有设置周期性。但是优化过程中出现这样的警告是什么原因。以下是我的输入文件和配体结构

202503121958367367..png (276.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202503121958367367..png

202503121954553937..png (113.24 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202503121954553937..png

CHO-Cu.inp

10.68 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

894

帖子

3

威望

1684

eV
积分
2638

Level 5 (御坂)

傻傻的木瓜

2#
发表于 Post on 2025-3-12 20:25:01 | 只看该作者 Only view this author
天,这个体系是怎么设置出CHARGE 186如此高的正电荷的?另外与Cu(II)配位的阴离子配体确认是CF3SO2-而不是三氟甲磺酸根CF3SO3-么……

这才一百二十多个原子的孤立体系,用Gaussian优化更合适吧
√546=23.36664289109

42

帖子

0

威望

197

eV
积分
239

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-12 20:42:39 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-3-12 20:25
天,这个体系是怎么设置出CHARGE 186如此高的正电荷的?另外与Cu(II)配位的阴离子配体确认是CF3SO2-而不是 ...

电荷我没设置,不知道咋整的为什么说是三氟甲磺酸根CF3SO3-呢

894

帖子

3

威望

1684

eV
积分
2638

Level 5 (御坂)

傻傻的木瓜

4#
发表于 Post on 2025-3-12 21:41:16 | 只看该作者 Only view this author
alenrose 发表于 2025-3-12 20:42
电荷我没设置,不知道咋整的为什么说是三氟甲磺酸根CF3SO3-呢

即使Multiwfn这样的软件能在辅助生成计算输入文件时尽量采用合适的设置,也绝对不意味着自己提交计算前不用检查电荷和自旋多重度等关键参数。

三氟甲亚磺酸根CF3SO2- (trifluoromethanesulfinate)和三氟甲磺酸根CF3SO3- (trifluoromethanesulfonate)是两个不同的阴离子,硫的成键状态以及对金属配位的形式应该有所差异,可以试着查查文献对类似配合物的表征并参照构建初始结构。实际要研究的配合物体系当然取决于你的课题咯,我只是顺便多问一句,肯定得确保计算建模与目标体系一致嘛。
√546=23.36664289109

42

帖子

0

威望

197

eV
积分
239

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-12 21:58:33 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-3-12 21:41
即使Multiwfn这样的软件能在辅助生成计算输入文件时尽量采用合适的设置,也绝对不意味着自己提交计算前不 ...

好的,谢谢提醒

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 21:44 , Processed in 0.152633 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list