求助：关于在lammps中模拟CO2，分子团聚现象如何解决

补药做分子 · 发表于 Post on 2024-12-30 16:28:53

MD模拟co2，n2混合气体时，采用nvt系综，出现分子团聚现象
尝试对co2设置为刚体
在in文件中加入了 fix 1 co2 rigid/nvt/small molecule temp 300 300 100 ，一直报错 Bad principal moments想请教各位老师，这种问题该如何解决，还请老师们批评指正！！

杨星元 · 发表于 Post on 2024-12-31 15:24:45

最后您解决了吗，我也是有这个问题，一模一样的情况，用的fix也是一样的命令

补药做分子 · 发表于 Post on 2025-1-1 20:13:47

没有还是卡在这个问题上

thor · 发表于 Post on 2025-1-2 10:14:41

把能量最小化步骤去掉

杨星元 · 发表于 Post on 2025-1-24 19:54:16

thor 发表于 2025-1-2 10:14
把能量最小化步骤去掉

去掉能量最小化就不对了吧，算出来结果不对的

thor · 发表于 Post on 2025-1-26 16:19:46

杨星元发表于 2025-1-24 19:54
去掉能量最小化就不对了吧，算出来结果不对的

算出来啥不对，能量最小化只是调整原子不合理的接触，能跑起来就行

wyf0829 · 发表于 Post on 2025-12-25 17:18:32

你好请问你的问题解决了吗我在模拟二氧化碳的时候在300K也出现了分子聚集但是在500K的时候没有发现这个现象

CO2CCC · 发表于 Post on 2025-12-28 13:09:43

请问这个问题应该如何解决，CO2刚性模型计算输运性质时的团聚现象

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[Lammps] 求助：关于在lammps中模拟CO2，分子团聚现象如何解决

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