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[新手求助] 求助如何考察先生成键后断开同一根键的反应

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各位老师,我在计算一个反应,是吸附在材料上的OH自由基与超氧负离子反应生成单线态氧气和氢氧根离子,如图
我翻阅文献后,猜测先生成OOOH-自由基中间体,后OOOH-自由基分解生成单线态氧气和氢氧根离子
我已找到OH自由基跟超氧负离子反应生成OOOH-自由基的过渡态,此时便可以计算出能垒,但突然想到一个问题,这个反应全过程是反应物1:OH自由基和超氧负离子经历过渡态1生成OOOH-自由基中间体,OOOH-自由基中间体再经历过渡态2分解生成单线态氧气和氢氧根离子,过渡态2和过渡态1的结构和能量一模一样,因为生成和断开的键是同一根,总感觉怪怪的,请问各位老师,在这个反应中,过渡态1和过渡态2的结构和能量一致,这是合理的嘛?




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发表于 Post on 2025-3-23 09:13:53 | 只看该作者 Only view this author
这个确定不是电子转移机理吗?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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发表于 Post on 2025-3-23 10:31:12 | 只看该作者 Only view this author
这明显不一样好吧,生成键的时候是均合(均裂的逆反应),断的时候是异裂,完全不一样。更重要的是,你要像楼上说的考虑是不是电子转移而不需要成键

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-24 07:52:38 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-3-23 09:13
这个确定不是电子转移机理吗?

也有可能是,目前实验上未对该反应的机理做表征,您说的电子转移机理我也考虑在内,但我翻阅文献,找到一种机理是生成OOOH-自由基,不过OH自由基去结合吸附在材料上的超氧负离子,跟我这个不太一样,机理如下图, ,所以我打算把两种可能的机理都计算一遍。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-24 08:09:48 | 只看该作者 Only view this author
tonganlhy 发表于 2025-3-23 10:31
这明显不一样好吧,生成键的时候是均合(均裂的逆反应),断的时候是异裂,完全不一样。更重要的是,你要像 ...

老师您说的很有道理,从化学上我也觉得不一样,不过我尝试把OOOH-的O-O键用柔性扫描拉长,得到个最高点,再把超氧负离子-OH自由基复合物的O-O原子距离用柔性扫描缩短,也得到个最高点,用两个最高点去找过渡态得到的过渡态一模一样,扫描过程和找过渡态均使用了guess=mix关键词,这一现象造成了我的误解
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发表于 Post on 2025-3-24 08:31:03 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-3-24 08:09
老师您说的很有道理,从化学上我也觉得不一样,不过我尝试把OOOH-的O-O键用柔性扫描拉长,得到个最高点, ...

(1)guess=mix并不保证得到的一定是自旋破缺的波函数,需要手动检查实际收敛到了什么波函数;(2)两个自由基复合,或者一根化学键均裂,如果有过渡态,过渡态并非一定是自旋破缺的
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2025-3-24 08:31:31 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-3-24 07:52
也有可能是,目前实验上未对该反应的机理做表征,您说的电子转移机理我也考虑在内,但我翻阅文献,找到一 ...

如果这个OOOH自由基是纯实验的文献提出的,且没有直接的实验证据,那么不要信
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-24 08:43:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-3-24 08:31
如果这个OOOH自由基是纯实验的文献提出的,且没有直接的实验证据,那么不要信

这个机理确实是纯实验的文献提出的,而且没实验证据,不过引用了一篇Chemical Review,但我去看了那篇Chemical Review并没有看到里面有提到OOOH-自由基。此外想询问一下老师,计算这个反应的电荷转移,是用Marcus理论计算吗?
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发表于 Post on 2025-3-24 12:41:51 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-3-24 08:43
这个机理确实是纯实验的文献提出的,而且没实验证据,不过引用了一篇Chemical Review,但我去看了那篇Che ...

对,Marcus理论精度不高,但比它精度高的方法都很麻烦
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-25 06:16:33 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-3-24 12:41
对,Marcus理论精度不高,但比它精度高的方法都很麻烦

好的,谢谢老师的解答。
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