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[ORCA] 推荐dlpno-steom-ccsd算激发态能量

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作为实验为主的小组,基于省钱的目的,长期以来都用各种TDDFT筛选目标化合物。

可能是打算合成的分子都相对较大,一直以来还没有哪种TDDFT真的对实验有明显指导作用,计算的激发能和实验相比总是偏大或偏小,关键每次偏离的幅度还不相同。

社长曾说eom-ccsd好,但我的分子用高斯从来都是跑不动这个方法的。8月4.2推介了dlpno-steom-ccsd,姑且一试,结果出乎意料!

60个原子的分子,居然跑动了!!!换了几种以前合成的分子,结果和实验符合的一匹。

换成80个原子的分子,结果和实验差距不超过10nm,简直热泪盈眶。

强烈推荐各位试试。



当然,大内存、大硬盘是必须的,特别是后者。我现配了8Tssd

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发表于 Post on 2019-11-11 09:04:08 | 只看该作者 Only view this author
这硬盘和内存望而生畏啊。。。话说80个原子的分子你给了多少资源计算的,花费了多长时间?麻烦分享下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-11 09:52:54 | 只看该作者 Only view this author
240G, 8core,33hr。应该都能接受的。

ssd,4T不够,8T够了

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发表于 Post on 2019-11-11 10:17:58 | 只看该作者 Only view this author
8Tssd!

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发表于 Post on 2019-11-11 10:21:24 | 只看该作者 Only view this author
8T还是有点猛···
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2019-11-11 10:40:06 | 只看该作者 Only view this author
对比过EOM-CCSD和STEOM-CCSD的结果,有时候差异不小。这样大小体系,我还是优先考虑TD-wB2GP-PLYP
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-11-11 15:11:50 | 只看该作者 Only view this author
8T够夸张了,不过不能多给点核心吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-11 21:38:48 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2019-11-11 15:11
8T够夸张了,不过不能多给点核心吗

内存不够。瓶颈还是在硬盘IO上

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发表于 Post on 2019-11-11 22:22:37 | 只看该作者 Only view this author
shalene 发表于 2019-11-11 21:38
内存不够。瓶颈还是在硬盘IO上

openmpi并行太坑了,简直是吃内存无底洞,不是NVME的SSD?

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发表于 Post on 2020-12-14 12:51:31 | 只看该作者 Only view this author
我试了几回,15个原子的有机小分子,直接内存爆了,自动退出了。我的服务器双路CPU,XEON Platinum 8173M,192G内存,1T的固态硬盘。@shalene

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发表于 Post on 2020-12-14 16:30:51 | 只看该作者 Only view this author
steom-ccsd比eom-ccsd多了一些三激发,适合描述电子关联比较强的体系以及电荷转移激发态。缺点是选择活性空间的迭代步骤经常不收敛导致计算中断,并且只有“active character higher than 98.0”的激发能才是可靠的。活性空间大了或者小了都可能达不到此标准

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-17 15:34:26 | 只看该作者 Only view this author
solvation 发表于 2020-12-14 12:51
我试了几回,15个原子的有机小分子,直接内存爆了,自动退出了。我的服务器双路CPU,XEON Platinum 8173M, ...

我256G内存,最多8核并行,经常是6核。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-17 15:37:56 | 只看该作者 Only view this author
beefly 发表于 2020-12-14 16:30
steom-ccsd比eom-ccsd多了一些三激发,适合描述电子关联比较强的体系以及电荷转移激发态。缺点是选择活性空 ...

谢谢,目标分子确实都是CT化合物。泛函都是渣渣,包括wb2gpplyp。

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发表于 Post on 2020-12-17 17:55:54 | 只看该作者 Only view this author
shalene 发表于 2020-12-17 15:37
谢谢,目标分子确实都是CT化合物。泛函都是渣渣,包括wb2gpplyp。

最近用B2PLYP算了一些CT化合物,比其他泛函还是好很多的,但是10nm级的精度还是远远达不到
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2020-12-18 21:23:25 | 只看该作者 Only view this author
beefly 发表于 2020-12-14 16:30
steom-ccsd比eom-ccsd多了一些三激发,适合描述电子关联比较强的体系以及电荷转移激发态。缺点是选择活性空 ...

我的可能就是这个原因;有没有可能是内存还是不够?

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