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[ORCA] MOF团簇结构优化难收敛

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本帖最后由 njust-lbc 于 2025-4-23 11:38 编辑

请问各位老师,我手上有一个含有镍原子的MOF结构。我先用CP2K对整个MOF结构做了结构优化(输入输出文件如下),之后截取出来一个团簇结构,只对氢原子做结构优化,试了一些方法还是很难收敛(输入输出文件如下)。请问还有什么好的方法可以收敛吗?

屏幕截图 2025-04-23 112706.jpg (84.25 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

屏幕截图 2025-04-23 112706.jpg

Ni-b-MOF-crystal.inp

7.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 10

ORCA输入文件

orca.out

213.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

ORCA输出文件

Ni-b-MOF.inp

42.05 KB, 下载次数 Times of downloads: 9

CP2K输入文件

cp2k.out

280.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

CP2K输出文件

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发表于 Post on 2025-4-23 13:47:59 | 只看该作者 Only view this author
直接用CP2K做所有计算就完了,截出来完全多此一举,用ORCA算还耗时明显更高,又没法完美考虑周期性
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-24 08:39:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-4-23 13:47
直接用CP2K做所有计算就完了,截出来完全多此一举,用ORCA算还耗时明显更高,又没法完美考虑周期性

好吧,谢谢老师,看来也只能这样了。

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发表于 Post on 2025-4-24 17:19:00 | 只看该作者 Only view this author
你漏补了两个氢
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-24 19:44:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 njust-lbc 于 2025-4-24 19:51 编辑

没有啊,团簇截出来后我补了两个氢,是还有别的地方漏补了吗?

屏幕截图 2025-04-24 194351.jpg (55.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

屏幕截图 2025-04-24 194351.jpg

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发表于 Post on 2025-4-24 21:36:27 | 只看该作者 Only view this author
njust-lbc 发表于 2025-4-24 19:44
没有啊,团簇截出来后我补了两个氢,是还有别的地方漏补了吗?

检查导出结构后是不是漏复制了氢
你的orca输入文件里,62号和98号碳上没有氢(原子编号从1开始)
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-25 08:49:46 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-4-24 21:36
检查导出结构后是不是漏复制了氢
你的orca输入文件里,62号和98号碳上没有氢(原子编号从1开始)

啊,果然是!真神奇啊谢谢老师!

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