计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 235|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 求助slab+有机小分子体系几种方式计算的能量的差距太大

[复制链接 Copy URL]

82

帖子

0

威望

939

eV
积分
1021

Level 4 (黑子)

有下面四个结构 1号结构为slab+有机小分子的结构且小分子和slab 间距大于10埃,2号为优化后小分子吸附在slab上的结构,3,4分别为小分子和slab的单独结构。使用PBE/TZV2P-MOLOPT-SR-GTH 加上D3,现在算出的结构能量差距很大,按理说的1-3-4能量接近于0但是却达到-1.23 Ha 有机小分子的结合能结构2-3-4差距达到2.66Ha 请问一下各位老师问题。我还有以下的疑问
1.同一级别计算 开不开smearing  加不加D3 属于同一级别的吗?
2.计算结合能的时候 单独的slab和小分子需要和分子吸附在slab上的结构计算参数一致吗(这里指的是假如分子吸附在slab上的开了smearing和D3),那单独的单独的slab和小分子需要也需要开smearing和D3吗


ef843864-dea7-4e3e-b437-4820d8783fac.png (9.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

ef843864-dea7-4e3e-b437-4820d8783fac.png

新建文件夹 (4).zip

14.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

51

帖子

0

威望

349

eV
积分
400

Level 3 能力者

2#
发表于 Post on 2025-5-14 21:03:43 | 只看该作者 Only view this author
都需要开。计算能量时需要保持设置完全一致。
CP2K VASP Gaussian LAMMPS GROMACS欢迎交流

41

帖子

0

威望

390

eV
积分
431

Level 3 能力者

3#
发表于 Post on 2025-5-14 21:35:43 | 只看该作者 Only view this author
PLwang 发表于 2025-5-14 21:03
都需要开。计算能量时需要保持设置完全一致。

请问对于某些体系不开smearing不收敛。所以此时这种情况,由于为了让某一个模型的计算收敛,最终的设置要确定为所以的体系模型都要在开启smearing的情况下计算吗?

66

帖子

1

威望

1225

eV
积分
1311

Level 4 (黑子)

4#
发表于 Post on 2025-5-14 23:40:29 | 只看该作者 Only view this author
1.不属于
2.都开

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120132

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2025-5-14 23:47:39 | 只看该作者 Only view this author
Assiduitas 发表于 2025-5-14 21:35
请问对于某些体系不开smearing不收敛。所以此时这种情况,由于为了让某一个模型的计算收敛,最终的设置要 ...

要么都开smearing,要么把开smearing的计算的能量外推到T=0K再和不开smearing的计算进行对比

D3要加就都得加,否则根本不是同一个计算级别,如同用了不同泛函(只不过单原子的可以不用加,因为此时色散校正能为0)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 01:27 , Processed in 0.151648 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list