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我按照上边的方法"从http://sobereva.com/attach/652/gview_color.tcl下载gview_color.tcl文件,将之放到VMD目录下(即VMD启动后在文本窗口里输入pwd命令后显示的目录),然后在VMD的vmd.rc文件末尾加入一行proc gview {} {source gview_color.tcl}。如果你不了解vmd.rc文件的话,看《VMD初始化文件(vmd.rc)我的推荐设置》(http://sobereva.com/545)。
启动VMD后,在文本窗口里输入gview,就可以把默认的元素着色方案替换成和GaussView相同的了。之后载入个含有元素信息的结构文件(比如pdb、xyz等),然后在Graphics - Representation里把Coloring Method设为Element即可看到按元素着色的效果。如果想和GaussView显示的图像特征尽可能接近,将Drawing Method设为CPK,Bond Radius设为0.2,Material设为AOShiny。"改了一下我用Multiwfn+VMD得到的PVDF的ESP图里的原子颜色,最后得到的更改效果是所有原子颜色都变成蓝色的了。。。这是啥原因呢? |
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