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本帖最后由 yvhuachen 于 2025-7-3 11:34 编辑
如题,本人租用的是某中心的计算平台,配置为"单节点192核,AMD EPYC 9654@2.4GHz,768G内存,DDR5,IB高速网",计算一个原子数为454个的有机分子,含C H O N S, +1价阳离子,用的是sob老师在Multiwfn中配套的RESP2_ORCA.sh脚本,ORCA部分是能正常结束任务并输出Molden文件,但Multiwfn一直会内存溢出,即使占用整个节点的内存仍然不够(755gb),导致无法输出.chg文件,是因为体系过大必须要占用更多的内存还是本人设置问题,求教原因,非计算专业小白,诚心求教各位大佬。
Multiwfn计算时使用的是32核,srun -n 32 $Multiwfn SP.molden -ispecial 1 > /dev/null << EOF (P.S. 如果不规定运算核数的时候Multiwfn默认4核运行,这时不会出现内存溢出的情况,但因为分子比较大,运行10h后仍然没有结束任务,也不知道怎么监控到哪一步了就停了)
修改的脚本,运行日志,及内存使用记录图片已作为附件上传
第一次发帖,如果分区不对或措辞不当请sob老师,各位大佬及管理员轻喷,谢谢。
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